Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms