Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 MUTYH-236ENST00000529984 1029 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC011773.4-202ENST00000566000 1264 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CREB5-205ENST00000409603 1944 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC006372.1-201ENST00000449903 546 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC022217.2-201ENST00000518941 472 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 TXN2-204ENST00000416967 1280 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AL583824.1-203ENST00000457948 761 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 C5orf60-208ENST00000625191 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AL021407.3-201ENST00000407522 486 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CMTM1-206ENST00000457188 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 SLC25A5P6-201ENST00000515328 886 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CMTM1-215ENST00000531885 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC104423.1-201ENST00000591742 728 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CLPP-204ENST00000596149 745 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 BACH1-AS1-202ENST00000615718 700 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC010325.1-203ENST00000636757 380 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 FCER1A-201ENST00000368114 765 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 HSPB11-204ENST00000371378 894 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 WFDC2-202ENST00000339946 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 WFDC2-204ENST00000372676 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 MIR197-201ENST00000384976 75 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153 ms