Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms