Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SPRR1BP22528 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms