Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 HIST1H2BE-202ENST00000634910 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PLEKHG5-208ENST00000400915 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 DPY19L2P3-201ENST00000414296 2326 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CRYZ-205ENST00000417775 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CTBP1-AS2-202ENST00000505364 2423 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SCN4B-201ENST00000324727 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 FDXACB1-201ENST00000260257 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ZMAT4-202ENST00000315769 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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RAB4AP20338 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 RHD-210ENST00000622561 3007 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 BCL2L11-218ENST00000615946 5026 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 BCL2L11-220ENST00000620862 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PHACTR3-201ENST00000355648 2247 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ATP11AUN-201ENST00000623100 2241 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 MPP2-202ENST00000377184 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SLC18A1-201ENST00000265808 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TUBB8-204ENST00000564130 2438 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 GUCY1A3-207ENST00000511108 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CIZ1-225ENST00000538431 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SEC14L2-214ENST00000615189 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 YTHDC2-201ENST00000161863 6316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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