Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms