Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC37.81■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms