Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01558Q9Y6Z2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01558Q9Y6Z2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms