Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG1Q9Y678 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPG1Q9Y678 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPG1Q9Y678 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms