Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPQQ9Y646 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPQQ9Y646 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPQQ9Y646 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CPQQ9Y646 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms