Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TIMM9Q9Y5J7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM9Q9Y5J7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms