Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G6

PCDHGA7, Protocadherin gamma-A7, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA7Q9Y5G6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA7Q9Y5G6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA7Q9Y5G6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms