Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB12Q9Y5F1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms