Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPRKBQ9Y3C4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms