Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms