Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP3Q9Y2W7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms