Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSAQ9Y285 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FARSAQ9Y285 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSAQ9Y285 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSAQ9Y285 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSAQ9Y285 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FARSAQ9Y285 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms