Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms