Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAF8Q9UPN6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms