Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms