Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms