Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF19Q9UMS4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms