Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CIZ1Q9ULV3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CIZ1Q9ULV3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.4 ms