Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLBQ9ULI2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RIMKLBQ9ULI2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMKLBQ9ULI2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms