Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PADI1Q9ULC6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms