Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB23Q9ULC3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB23Q9ULC3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB23Q9ULC3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms