Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA3Q9UL41 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms