Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP8AP2Q9UKL3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms