Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXL4Q9UKA2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms