Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms