Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SALL4Q9UJQ4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms