Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms