Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms