Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms