Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms