Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA9Q9UGM1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms