Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3BQ9UBC3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms