Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCOR3Q9P2K3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms