Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP35Q9P2H5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms