Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHPF2Q9P2E5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms