Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAMSAP3Q9P1Y5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms