Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCHIP1Q9P0W5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms