Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFNKQ9P0W0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms