Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD2

GLTP, Glycolipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPQ9NZD2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLTPQ9NZD2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLTPQ9NZD2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLTPQ9NZD2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLTPQ9NZD2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLTPQ9NZD2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLTPQ9NZD2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms