Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms