Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms