Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC5A4Q9NY91 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms