Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT1Q9NXH9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRMT1Q9NXH9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMT1Q9NXH9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms