Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMPD4Q9NXE4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms