Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM161AQ9NX61 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms